Kolejne przygody szybkiego jak błyskawica i dzielnego jeża. W drugim sezonie łączy on siły z Shadow, który potrafi kontrolować chaos. Wspólnie poszukują fragmentów Pryzmatu Paradoksu, aby naprawić szkody wyrządzone przez Sonica w czasoprzestrzeni. Śmiałków czeka starcie z nowymi przeciwnikami.Nine w końcu uświadamia sobie swoje błędy, jednak na prostą naprawę jest już za późno. Ocalenie Odłamkowersum będzie wymagało ogromnego poświęcenia, lecz Sonic nie zamierza się poddać i zrobi wszystko, by uratować przyjaciół.