Żółwie Ninja powracają z czterema nowymi przygodami. Raph staje do walki na arenie walk mutantów, Donnie mierzy się ze zwariowanym naukowcem i jego wynalazkami, Leo zakłada strój superbohatera, by zmierzyć się z superzłoczyńcą, a Mikey, kierowany swoją ciekawością walczy z Szlamanem.Pojawia się coraz więcej pytań. Kto porwał Roda, gdzie jest mutagen i czemu jego rodzina jest tak dziwna? Śledztwo prowadzi do konfrontacji z ojcem Roda, ale czy z jego pomocą Mikey i bracia zdołają pokonać mutanta znanego jako Śluzarz?