Żółwie Ninja powracają z czterema nowymi przygodami. Raph staje do walki na arenie walk mutantów, Donnie mierzy się ze zwariowanym naukowcem i jego wynalazkami, Leo zakłada strój superbohatera, by zmierzyć się z superzłoczyńcą, a Mikey, kierowany swoją ciekawością walczy z Szlamanem.Nikt nie przepada za Rodem, a szczególnie Żółwie. Były stażysta Bishop chce je porwać, by zdobyć ich zmutowaną krew. Porwany zostaje jednak Rod, a sprawą zajmuje się Mikey. Pierwsze podejrzenia padają na Bishop, która jest twórczynią Mechazoida.