Kolejne przygody szybkiego jak błyskawica i dzielnego jeża. W drugim sezonie łączy on siły z Shadow, który potrafi kontrolować chaos. Wspólnie poszukują fragmentów Pryzmatu Paradoksu, aby naprawić szkody wyrządzone przez Sonica w czasoprzestrzeni. Śmiałków czeka starcie z nowymi przeciwnikami.Nine zdobył już wszystkie fragmenty Pryzmatu Paradoksu i jest o krok od spełnienia marzenia o własnym świecie. Jednak Pryzmat może się ustabilizować wyłącznie dzięki energii, którą nadal posiada Sonic.