Wkraczający w dorosłość młody czarnoksiężnik Merlin (Colin Morgan) broni Królestwa Camelot i jego władców przed wrogami. Szczególną opieką otacza młodego księcia Arthura (Bradley James), który w tej serii zostaje koronowany na króla. Czarodziej próbuje pokrzyżować szyki demonicznej Morganie (Katie McGrath) i innym przedstawicielom sił zła. Wielokrotnie stawia czoła mitycznym, jak i rzeczywistym wrogom. Dzięki walce z mrocznymi mocami Merlin zdobywa tajemną wiedzę, która w przyszłości pozwoli mu zdobyć sławę potężnego czarnoksiężnika.Na zamek przybywa Julius Borden, tajemniczy przybysz. Posiada on ważne wiadomości na temat magicznego sekretu, który może na zawsze zmienić losy królestwa. Borden prosi o pomoc w poszukiwaniach ostatniej, trzeciej części klucza do grobowca Ashkanara. W tym starożytnym mauzoleum spoczywa bowiem niezwykły skarb skarb, ostatnie zachowane jajo smoka. Mimo ostrzeżeń Gaiusa Merlin postanawia zaufać Bordenowi i pomóc mu odnaleźć brakującą część klucza.