Dwanaście lat przed wydarzeniami na których koncentruje się seria, Lis-demon o dziewięciu ogonach zaatakował wioskę Konoha. Jego atak spowodował chaos i śmierć wielu ludzi. Sytuację opanował Czwarty Hokage, który pokonał Kyubiego. Przy okazji poświęcił swoje życie i oddał duszę Bogu Śmierci, aby zapieczętować demona wewnątrz nowo narodzonego dziecka. Czwarty po zapieczętowaniu dziewięcioogoniastego został uznany za bohatera.Naruto, Sakura, Shikamaru i Pakkun są ścigani przez ninja z wioski dźwięku. Shikamaru postanawia zostać i zastrzymać wroga, aby dać przyjaciołom więcej czasu na dogonienie Sasuke. Technika władania cieniem sprawia, że Shikamaru najlepiej nadaje się do tego zadania, choć nie jest tym zachwycony.