Zaginiona Atlantyda została zbudowana przez starożytną cywilizację, której wiedza techniczna znacznie przewyższała ludzką. Międzynarodowa grupa naukowców wojskowych znajduje miasto. Okazuje się, że dzięki nowej technologii, odkrytej w mieście-statku, mogą korzystać z sieci gwiezdnych bram i podróżować po całym wszechświecie. Czeka ich jednak walka z nowym przeciwnikiem, tajemniczą rasą istot zwanych Widmami. Żywią się one ludzką siłą życiową.Ekspedycja Atlantis zostaje pozwana do sądu za zbrodnie przeciwko Galaktyce Pegaza. Oskarża ich grupa ludzkich cywilizacji, która stworzyła "Koalicję". Jednak jeden z dygnitarzy w Koalicji być może pracuje dla Genii. Richard Woolsey broni członków ekspedycji.