Serial jest kontynuacją filmu "Gwiezdne Wrota". Kolejne odcinki ilustrują wyprawy do innych światów przy wykorzystaniu wrót nadzorowanych przez wojskowych. Wrota działają tu w obie strony i mogą przez nie przebywać również przybysze z innych wymiarów: zarówno dobrzy, jak i siejący zagładę. Wyprawami dowodzi pułkownik O'Neil (Richard Dean Anderson).Whilst, O'Neill i Carter jadą do Waszyngtonu na uroczystość odznaczenia ich przez Prezydenta. Odkrywają jednak przeciek dotyczący spraw bezpieczeństwa. Jackson i Teal'c wybierają się na Abydos (po odkopaniu gwiezdnych wrót), aby spotkać się z ojcem Sha're. Muszą oznajmić mu, że nie udało im się odnaleźć Sha're. Jedyne, co udało im się ustalić, jest to, że Sha're przebywa już na Abydos. Wkrótce dowiadują się, że dziewczyna jest w ciąży z Apophisem. Dziecko, które urodzi, skrywa tajemnice Goa'ulda.