Agentka specjalna Jane Tennant (Vanessa Lachey) i jej podwładni zmagają się ze sprawami kryminalnymi w Pearl Harbor na Hawajach. Dotyczą one ewentualnych zagrożeń dla bezpieczeństwa narodowego Stanów Zjednoczonych. Pomagają im wykwalifikowani specjaliści i lokalni mieszkańcy.Ekipa NCIS zajmuje się sprawą kontenera transportowego wypełnionego przemycaną bronią. Podczas śledztwa drogi śledczych i zespołu Whistler znów się krzyżują. Tymczasem Tennant zastanawia się nad aresztowaniem ojca kolegi jej syna. Dla chłopaka będzie to oznaczać kolejną przeprowadzkę.