Do głównych zadań detektywów rządowej agencji NCIS należy wykrywanie przestępstw, które są powiązane z marynarką wojenną bądź korpusem piechoty morskiej. Emerytowany oficer dochodzeniowy Jethro Gibbs (Mark Harmon) często służy swoją pomocą w prowadzonych śledztwach. Do zespołu należą: szef ekipy Anthony DiNozzo (Michael Weatherly), który wcześniej pracował w wydziale zabójstw w Baltimore, Timothy McGee (Sean Murray) - specjalista od komputerów, Abby Sciuto (Pauley Perrette) - znawczyni medycyny sądowej, doktor Donald "Ducky" Mallard (David McCallum) - lekarz sądowy, a także Ziva David (Cote de Pablo) - funkcjonariuszka izraelskiej agencji wywiadowczej. Wszystkimi agentami kieruje dyrektor Jenny Shepard (Lauren Holly), dawna miłość Gibbsa.Gibbs angażuje się w sprawę, która wiąże się z jego przeszłością i bolesnymi wspomnieniami. Detektyw znów rozmyśla o swojej zmarłej tragicznie przed kilkunastu laty córce, gdy zaczyna pomagać jej znajdującej się w niebezpieczeństwie dawnej przyjaciółce. Przy okazji prowadzonego dochodzenia agent poznaje wstrząsające fakty, które bezpośrednio go dotyczą.