W kolejnym sezonie, dwunastym, zespół Gibbsa (Mark Harmon) znów stawi czoła zagadkom kryminalnym, w których nie wszystko jest tym, czym się wydaje na pierwszy rzut oka. Agenci muszą m.in. odnaleźć zabójcę dowódcy marynarki wojennej, eskortować geniusza komputerowego i poznać okoliczności śmierci Anglika przebywającego w USA.Zostaje zamordowany pułkownik marynarki wojennej, który miał być pierwszym homoseksualistą odznaczonym Medalem Honoru. Palem organizuje imprezę z okazji zbliżających się narodzin swojego dziecka.