Rok 2089. Dwoje archeologów odkrywa w Szkocji piktogramy wykonane ponad 35 tys. lat wcześniej. Ilustrują one układy gwiazd zbliżone do tych, które stworzono w starożytności. Naukowcy uznają, że ludzkość została zapoczątkowana przez pozaziemską inteligencję zwaną Inżynierami. Kilka lat później miliarder Weyland sponsoruje wyprawę na odległy księżyc. Na miejscu członkowie załogi natrafiają na tajemniczą budowlę i ślady obcych. Dopiero teraz badaczka Elizabeth Shaw oraz inne osoby biorące udział w ekspedycji zostają poinformowani, że celem misji jest ustalenie, kto stworzył człowieka. Poszukiwanie odpowiedzi na to pytanie wiąże się z niebezpieczeństwem. Podróżnicy trafiają do świata z koszmaru. Nieznana rasa przewyższa ich pod każdym względem.